在传统成本制度下，一般需设置“原材料”、“生产成本”（在产品）、“库存商品”、“主营业务成本”等会计科目，而在JIT制度下，由于它不同于以往的传统成本制度，因而在账户设置与会计处理上也是有所区别的。这主要体现在：
 

　　1、设置“原材料与在产品”账户
 

　　在JIT制度下，由于在产品数量极少，没有必要为其单独设置账户，可将其与原材料账户合并。当购入材料时，直接记入“原材料与在产品“账户。
 

　　2、设置“加工成本“账户
 

　　所谓加工成本，是指直接人工成本与制造费用。在JIT制度下，由于自动化水平相对较高，直接人工成本金额很少，因此将其与各项制造费用合并记入“加工成本”账户。
 

　　3、分配制度费用的时点
 

　　在传统成本制度下，分配制造费用的时点一般都选择产品生产完成时或期末时，而且都是先分配记人“生产成本”，再转入“库存商品”。然而，在JIT制度下，制造费用的分配，通常都是在产品生产完成时进行。
 

　　在纯粹的JIT环境下，产品生产完成时即为出售产品之时，因此，可将使用（等于购入）的材料与加工成本直接计入销售成本。但是，这种纯粹的JIT在现实中很难实现。因此，如果发生生产量大于销售量，或存在加工未完成的在产品，则可将销售成本账户中的一部分调整转出，作为“库存商品”或“原材料与在产品“账户的结存数。